安装通风柜后，将其放置在可以避免交叉气流的地方。许多事情会造成一个横流，包括：
1、人员走动
2、门的打开和关闭
3、窗户
4、供应空气扩散器
5、外部风扇
尽管避免高流量区域对于确保大限度的污染物控制非常重要，但实验室工作人员在通风柜周围移动也是如此。避免进出通风柜的快速运动，否则可能会造成空气干扰。
在开始工作之前，实验室技术人员应始终确保排气正常。排出烟雾是通风柜的主要工作，因此如果通风系统的这部分不工作，则通风柜将无法有效运转。
确保排气工作时，检查挡板。这些是可移动的隔板，在通风柜后部形成开口。它们保持气流均匀，从而提。检查可能阻碍气流的任何障碍物。
此外，如果通风柜包含气流监视器，请定期检查监视器的状态。确保其正常运行将使你能够更好地检查任何的气流变化。
实验平台可分为三种类型：双面岛型，半岛型和单面壁型。 岛型实验平台易于撤离，因为实验者可以自由移动，交通量大。 试验台之间应留有适当的安全距离，通常不小于130厘米。 但是，如果在测试台前需要特殊设备（例如储气瓶等），则测试台之间的净距应为160-180 cm。 由于相邻测试台的操作员以“背对背”的方式操作，因此，如有必要，可以在测试台通道的中间添加一个隔板，隔板由不燃材料组成，以防止化学物质进入 伤害背部的实验者。 此时，应适当增加测试台之间的距离。 实验台与通风橱之间的安全距离不应小于125厘米。
通风柜的风量平衡可以采用定风量控制系统，即排风量恒定，送风量和门窗缝隙补充风量恒定。此方法适用于排风量满足换气次数要求的实验室。对于排风量远大于通风量要求的房间还可以采用两段式通制系统保证风量平衡，即根据通风柜的位移信号，排风机、送风机有2种送风工况，低风量工况应用于维持换气次数的要求，节约能耗。此情形药检所采用了变风量控制系统。
通风柜风量变化时，排风量也会相对变小，此时杭州通风柜要求放置在屋顶的排风机随着通风柜柜门的位置变化而变频，降低风量，保证通风柜面风速恒定。同时自控系统改变全新风风机的频率，降低风量，维持负压平衡。变风量系统可以降低系统能耗。系统、换气次数接近则考虑采用定风量系统，使得系统简单，降低初投资。
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